Cependant, compte tenu d`un seuil de valeur q de 0,1, des associations significatives ont été identifiées par des modèles simplex et duplex pour les solides solubles, la densité des bourgeons floraux et le pH, mais pas par le modèle général. Selon Rosyara et coll. (2016), il y a un compromis entre la souplesse et le pouvoir, parce que le modèle général exige un plus grand nombre de degrés de liberté, ce qui entraîne une puissance statistique plus faible. Référence: Ferrão LFV, Benevenuto J, de BEM Oliveira I, Cellon C, Olmstead J, Kirst M, Resende MFR Jr et Munoz P (2018) aperçu de la base génétique des traits liés aux myrtilles à l`aide de modèles diploïdes et polyploïdes dans un contexte de GWAS. Avant. Ecol. Evol. 6:107. doi: 10.3389/Fevo. 2018.00107 figure 7. Effet SNP sur la taille des fruits. (A) gène candidat codant une protéase de type rhomboïde chloroplaste (CUFF.
39364.1) où une variante de mauvais sens a été détectée dans le deuxième exon. (B) importance des SNP détectés par des modèles d`action génique additifs (points gris) et généraux (points bleus) le long de la scaffold01404. La ligne pointillée verte indique la région génique affectée par les deux SNP significatifs. les barres doubles indiquent hors de l`échelle. (C) positions d`échafaudage des SNP, soulignant les SNP associés au trait en vert. (D) déséquilibre de liaison pairwise (coefficient de corrélation R2) entre les marqueurs le long de l`échafaudage. Les études polyploïdes tenant compte de l`abondance relative de chaque allèle à un locus particulier dans le génome permettent de tester des modèles génétiques plus réalistes. Par exemple, l`utilisation de la posologie d`allèle a influé sur la construction de cartes de liaison génétiques (Mollinari et Serang, 2015), le calcul des fréquences d`allèle observées et attendues (Dufresne et coll., 2014), et l`inférence de la structure et des schémas de la population de la démographie historique (Blischak et coll., 2016). Sur la base des études d`association à l`échelle du génome, nos résultats ont appuyé l`importance d`inclure la posologie allélique pour identifier les associations significatives de SNP-trait. En modélisant les génotypes tétraploïdes sous un seuil de q-valeur de 0,05, au moins une association SNP-trait a été détectée pour cinq traits dans une population d`élevage de bleuets, et aucun groupement n`a été détecté pour la taille des fruits, le pH et les traits solides solubles lorsque le dosage effet a été omis.